Depuis sa création en 1989, le PIREN-Seine s’intéresse notamment à la qualité des masses d’eau du bassin versant de la Seine. L’approche interdisciplinaire du programme lui a permis en phase 8 de contribuer au suivi de l’évolution de ces indicateurs dans des perspectives spatio-temporelles diverses, par (i) le biais d’archives sédimentaires pour le suivi des trajectoires de contaminations historiques, notamment sur les contaminants persistants ainsi que par des travaux sur la biogéochimie de l’axe fluvial, et (ii) par des approches de monitoring et biomonitoring de l’axe fluvial.